小智（松本莉香配音）来自真新镇，他的目标是要成为神奇宝贝顶级训练师。在即将展开训练师旅程的一天，因为迟到，他并没有拿到初始的小精灵。大木博士（石冢运昇配音）见状，便送了一只不愿进精灵球和非常调皮的皮卡

在电影开始开篇，场景好像被设置在一片大森林中。在森林内,一声强力的呼救被一个叫Yukinari的男孩听到了。Yukinari是一个在残酷社会中比较天真的男孩，但这次经历对他来说是可能使他终身受益。当他

在地势险峻的山谷腹地，勇猛果敢的神奇宝贝凯尔迪奥（中川翔子配音）追随传说中的圣剑士克巴路欧（山寺宏一配音）、泰利奇欧（安元洋贵配音）、比利基恩（本田贵子配音）修行，朝着圣剑士的目标持续努力。自不量力的

以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香配音）、小刚（うえだゆうじ配音）和小霞（豊口めぐみ配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地

在日本岐阜县某座城市，生活着无忧无虑的小黑猫鲁道鲁夫（井上真央 配音）。原本优哉游哉陪伴着小主人理惠的他，不小心钻进了货柜车中，结果一路被带到了东京。在这座完全陌生的大都会里，他邂逅了认识人类文字的流

在风景秀丽，气候宜人的王冠市，即将举行神奇宝贝足篮世界杯比赛，届时，大批的观众和训练师会涌入此处，整个城市将会陷入一片欢乐的海洋之中。小智（松本梨香 配音）一行人正在前往王冠市的路上，旅途中，他们遇见

为了成为合格的神奇宝贝训练师，小智（松本梨香 配音）、天桐（宫野真 配音）、艾莉丝（悠木碧 配音）带着各自的小伙伴继续在世界各地旅行。这次他们来到了美丽的山中小镇艾茵多奥克参加神奇宝贝的比赛，在比赛的

故事讲述的是一群疯狂的科学家，为了自己的梦想，研制出一套只需要少许基因便可复制出宝可梦的机器，并把发掘到的世界最强宝可梦复制成了拥有比梦幻更强能力的超梦。但当超梦醒来后，却因无法找寻到真正的自我而暴走

持续在世界各地进行修业之旅的小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音），历经长途跋涉终于来到了位于山谷丘陵处的目的地阿拉莫斯镇。小镇上耸立着象征时间与空间的时光之塔，

神奇宝贝广场是为神奇宝贝而准备的游戏场所。皮卡丘、波克比、杰尼龟，还有一些大家熟悉的神奇宝贝们，都在那里快乐游玩。但，皮卡丘与杰尼龟等同伴因为小事跟别的神奇宝贝吵起来，吵醒了在睡觉的波克比，也引起了一